MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ATCC BAA-2069 plasmid pSGG1

Total Repeats: 466

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015219	A	6	6	1	6	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015219	T	8	8	15	22	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015219	ATT	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015219	TAT	3	9	206	214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015219	T	6	6	223	228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015219	ATA	2	6	240	245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015219	GCT	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926839
8	NC_015219	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926839
9	NC_015219	CTG	2	6	369	374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325926839
10	NC_015219	AACC	2	8	459	466	50 %	0 %	0 %	50 %	325926839
11	NC_015219	T	6	6	469	474	0 %	100 %	0 %	0 %	325926839
12	NC_015219	TTTGA	2	10	602	611	20 %	60 %	20 %	0 %	325926839
13	NC_015219	AAC	2	6	733	738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926839
14	NC_015219	ACC	2	6	748	753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325926839
15	NC_015219	CGA	2	6	860	865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926839
16	NC_015219	CATGA	2	10	1057	1066	40 %	20 %	20 %	20 %	325926839
17	NC_015219	TAT	2	6	1257	1262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926839
18	NC_015219	ATA	2	6	1321	1326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926839
19	NC_015219	T	7	7	1383	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015219	A	6	6	1395	1400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015219	CAA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015219	CTA	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015219	ACAA	2	8	1490	1497	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015219	ATT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015219	CCG	2	6	1608	1613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015219	ATCGC	2	10	1648	1657	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015219	CTCAAA	2	12	1721	1732	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015219	CAA	2	6	1870	1875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015219	TCC	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015219	TTAATT	2	12	1917	1928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015219	ACG	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015219	TGA	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015219	TCC	2	6	2031	2036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015219	CAC	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015219	TCC	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015219	TCAGC	2	10	2146	2155	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_015219	AAC	2	6	2163	2168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015219	A	7	7	2242	2248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015219	ACCAC	2	10	2267	2276	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_015219	TGA	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015219	GCTA	2	8	2384	2391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015219	GCTTTT	2	12	2574	2585	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015219	A	6	6	2636	2641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015219	A	6	6	2653	2658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015219	A	7	7	2661	2667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015219	TAA	2	6	2668	2673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015219	A	6	6	2672	2677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015219	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015219	TTC	2	6	2788	2793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926840
50	NC_015219	T	6	6	2851	2856	0 %	100 %	0 %	0 %	325926840
51	NC_015219	TATT	2	8	2882	2889	25 %	75 %	0 %	0 %	325926840
52	NC_015219	T	6	6	2907	2912	0 %	100 %	0 %	0 %	325926840
53	NC_015219	T	6	6	3106	3111	0 %	100 %	0 %	0 %	325926840
54	NC_015219	ACA	2	6	3224	3229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926840
55	NC_015219	ATA	2	6	3272	3277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926840
56	NC_015219	AAAT	2	8	3295	3302	75 %	25 %	0 %	0 %	325926840
57	NC_015219	GTT	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926840
58	NC_015219	ATA	2	6	3334	3339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926840
59	NC_015219	TCA	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926840
60	NC_015219	AGAAA	2	10	3487	3496	80 %	0 %	20 %	0 %	325926840
61	NC_015219	A	6	6	3494	3499	100 %	0 %	0 %	0 %	325926840
62	NC_015219	TCT	2	6	3506	3511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926840
63	NC_015219	ATT	2	6	3547	3552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926840
64	NC_015219	TAT	2	6	3586	3591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015219	T	6	6	3591	3596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015219	T	9	9	3633	3641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015219	ATATA	2	10	3784	3793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015219	AATAT	2	10	3794	3803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015219	AT	4	8	3806	3813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015219	GATTTT	2	12	3823	3834	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015219	T	6	6	3831	3836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015219	A	7	7	3842	3848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015219	T	6	6	3876	3881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015219	CTTTT	2	10	3927	3936	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015219	T	6	6	3933	3938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015219	AGT	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015219	ACT	2	6	3968	3973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015219	T	7	7	3973	3979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015219	GAA	2	6	4025	4030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015219	GCC	2	6	4061	4066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015219	T	7	7	4074	4080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015219	T	6	6	4111	4116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015219	GAA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015219	AAG	2	6	4222	4227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015219	TAT	3	9	4265	4273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015219	A	6	6	4348	4353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015219	A	7	7	4358	4364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015219	AACTG	2	10	4373	4382	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015219	ATA	2	6	4415	4420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926841
90	NC_015219	TGT	2	6	4475	4480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926841
91	NC_015219	CCTGCT	2	12	4536	4547	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325926841
92	NC_015219	GTT	2	6	4623	4628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926841
93	NC_015219	TGA	2	6	4637	4642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926841
94	NC_015219	TTA	2	6	4671	4676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926841
95	NC_015219	ATA	2	6	4769	4774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926841
96	NC_015219	CAG	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926841
97	NC_015219	TTC	2	6	4871	4876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926841
98	NC_015219	TAGAC	2	10	4911	4920	40 %	20 %	20 %	20 %	325926841
99	NC_015219	CAT	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926841
100	NC_015219	TTC	2	6	5006	5011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926841
101	NC_015219	TTCCGT	2	12	5063	5074	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325926841
102	NC_015219	TTG	2	6	5168	5173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926841
103	NC_015219	GCTCCT	2	12	5187	5198	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325926841
104	NC_015219	T	6	6	5237	5242	0 %	100 %	0 %	0 %	325926841
105	NC_015219	TAAA	2	8	5266	5273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015219	ATC	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015219	TAA	2	6	5384	5389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015219	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015219	TAGT	2	8	5532	5539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015219	AT	3	6	5578	5583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015219	AAT	2	6	5612	5617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015219	T	6	6	5642	5647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015219	GAT	2	6	5663	5668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015219	TGA	2	6	5790	5795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926842
115	NC_015219	TATCC	2	10	5900	5909	20 %	40 %	0 %	40 %	325926842
116	NC_015219	TTA	2	6	6020	6025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926842
117	NC_015219	TCTT	2	8	6037	6044	0 %	75 %	0 %	25 %	325926842
118	NC_015219	CTC	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325926842
119	NC_015219	AAC	2	6	6175	6180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325926842
120	NC_015219	ACC	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325926842
121	NC_015219	CATGA	2	10	6499	6508	40 %	20 %	20 %	20 %	325926842
122	NC_015219	CTA	2	6	6555	6560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926842
123	NC_015219	AAT	2	6	6574	6579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015219	AGG	2	6	6593	6598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015219	CAG	2	6	6633	6638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926843
126	NC_015219	ATT	2	6	6645	6650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926843
127	NC_015219	CTA	2	6	6662	6667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926843
128	NC_015219	ACG	2	6	6738	6743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926843
129	NC_015219	ACT	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325926843
130	NC_015219	GAAAAA	2	12	6791	6802	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	325926843
131	NC_015219	A	6	6	6804	6809	100 %	0 %	0 %	0 %	325926843
132	NC_015219	ATT	2	6	6865	6870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926843
133	NC_015219	A	6	6	6921	6926	100 %	0 %	0 %	0 %	325926843
134	NC_015219	AC	3	6	6931	6936	50 %	0 %	0 %	50 %	325926843
135	NC_015219	AGC	2	6	6938	6943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325926843
136	NC_015219	TGA	2	6	6977	6982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325926843
137	NC_015219	AAT	2	6	7092	7097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325926843
138	NC_015219	TTGA	2	8	7098	7105	25 %	50 %	25 %	0 %	325926843
139	NC_015219	TA	3	6	7201	7206	50 %	50 %	0 %	0 %	325926843
140	NC_015219	AAG	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325926843
141	NC_015219	CT	3	6	7228	7233	0 %	50 %	0 %	50 %	325926843
142	NC_015219	TAT	2	6	7264	7269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325926843
143	NC_015219	TTTA	2	8	7315	7322	25 %	75 %	0 %	0 %	325926844
144	NC_015219	CTT	2	6	7363	7368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926844
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419	NC_015219	CT	3	6	18825	18830	0 %	50 %	0 %	50 %	325926857
420	NC_015219	T	7	7	18837	18843	0 %	100 %	0 %	0 %	325926857
421	NC_015219	CTT	2	6	18844	18849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325926857
422	NC_015219	GTT	2	6	18922	18927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325926857
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462	NC_015219	T	6	6	20582	20587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_015219	A	7	7	20593	20599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_015219	TCA	2	6	20600	20605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
465	NC_015219	T	6	6	20637	20642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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